• Blast2GO é um poderoso programa que permite que você faça anotações de seqüências e de análise de sequências. O software é uma solução adequada para a bioinformática campo, uma vez que oferece ferramentas completas para o funcional de anotação de seqüências. Em outras palavras, você pode anexar informações sobre as funções biológicas de seqüências de proteínas. Blast2GO oferece-lhe a possibilidade de executar a análise de dados complexos, em seguida, adicionar informações científicas sobre o comportamento dos genes ou seqüências de proteínas. Ele é baseado em Java, independente de plataforma, que permite que você para realizar análise abrangente de dados. O software pode acessar as bases de dados online ou bibliotecas de informações, assim, ser capaz de comparar ou acrescentar dados. Além disso, facilita a rápida anotação de um grande conjunto de dados, transferindo funcional etiquetas a partir de já analisou dados semelhantes conjuntos. O aplicativo também oferece várias ferramentas para análise estatística ou de visualização de dados. O aplicativo permite que você execute explosão de testes, a InterPro exames ou o mapeamento de dados, antes de adicionar uma grande série de anotações e a geração de gráficos estatísticos. Os informativos painéis na parte inferior da janela indica o progresso de vários processos em execução em paralelo, bem como o resultado da análise. Blast2GO permite que você coloque toda a projetos, sequências, análise de resultados, gene lista de símbolos ou anotações, bem como facilidade de exportação de conjuntos de dados. A análise implica a comparação com os serviços online. Por exemplo, a proteína de jateamento pode ser realizado através de CloudBlast, NCBI, a AWS ou Local da explosão. Você também pode executar uma InterProScan, usando um dos aplicativos disponíveis ou mapeamento da explosão hits, para cada sequência. O processo de anotação implica que você definir vários parâmetros, tais como, e-o Valor de bater filtro, HSP-hit cobertura ou computacional de análise de provas de códigos. Os resultados de anotar as sequências são exibidos na interface principal, sob o Comprimento, número de acessos, e-Valor, sim, dizer, IR acertos, VÁ lista, enzima lista e a InterPro de digitalização. Blast2GO pode exibir uma série de gráficos, em tabulado vista, na área abaixo da tabela principal. Distribuição gráficos podem ser gerados para o e-Valores de semelhança entre sequências, espécies e muitos mais. Além disso, cada seqüência de entrada é automaticamente colorida pendente de um teste, a fim de indicar a fonte de dados. O software é uma ferramenta adequada para bio-engenheiros que estudam o comportamento de genes e proteínas, por meio de experimentos.
  • Blast2GO dizileri ve dizi analizi açıklama olanak sağlayan güçlü bir programdır. Dizileri fonksiyonel açıklama için kapsamlı araçlar sunar beri yazılım biyoenformatik alanı için uygun bir çözümdür. Diğer bir deyişle, protein dizileri biyolojik işlevleri hakkında bilgi ekleyebilirsiniz. Blast2GO karmaşık veri analizi yapma imkanı sunuyor, sonra gen ya da protein dizileri davranışları ile ilgili bilimsel bilgi ekleyin. Kapsamlı veri analizi yapmak için izin veren bağımsız bir platform, bir Java tabanlı. Yazılım bilgileri çevrimiçi veritabanları ve kütüphaneler erişim, böylece verileri karşılaştırmak için ya da eklemek mümkün. Ayrıca, benzer kümeler için zaten analiz verileri fonksiyonel etiketleri transfer ederek büyük bir veri kümesinin hızlı açıklama kolaylaştırır. Uygulama, istatistiksel analiz veya veri görselleştirme için çeşitli araçlar sunar. Uygulama ek açıklamalar büyük bir dizi ekleme ve istatistiksel grafikler oluşturmadan önce patlama testleri, İnterPro tarar veya veri haritalama, gerçekleştirmek için izin verir. Pencerenin altındaki bilgilendirme panelleri paralel olarak analizi sonucu çalışan çeşitli işlemler ilerlemesini gösterir. Blast2GO tüm projeler, diziler, analiz sonuçları, gen semboller listesi veya ek açıklama olarak kolayca ihracat veri yükleme sağlar. Analiz çevrimiçi hizmetler ile karşılaştırma anlamına gelir. Örneğin protein patlama CloudBlast, NCBI, BÖLÜM veya Yerel patlamanın üzerinden yapılabilir. Ayrıca bir İnterProScan çalıştırın, patlama isabet mevcut uygulamalar veya eşleme, her sıra için birini kullanıyor olabilir. Bazı parametreleri (örneğin, e-vurmak filtre Değeri, HSP-kapsama veya sayısal analiz kanıt kodları isabet ayarladığınız açıklama süreci ifade eder. Dizileri notlar sonuçlarını ana arayüzünde, Uzunluk, Hit sayısı, e-Değeri, yani sim, hit GİT, liste, enzim listesi ve İnterPro tarama GİTMEK altındadır. Blast2GO grafikler bir dizi ekran, sekmeli görünümde, ana tablonun altındaki alanda olabilir. Dağıtım çizelgeleri e-Değerler dizisi benzerlik, türler ve çok daha fazlası için oluşturulabilir. Ayrıca, her sıra giriş veri kaynağı belirtmek için otomatik olarak bir test bekleyen renkli. Yazılım genler ve proteinlerin davranışlarını, deneyerek kim biyo-Mühendisler için uygun bir araçtır.
  • Blast2GO is a powerful program which allows you to annotate sequences and sequence analysis. The software is a suitable solution for the bioinformatics field, since it offers comprehensive tools for functional annotation of sequences. In other words, you can attach information regarding the biological functions of protein sequences.

    Blast2GO offers you the possibility of performing complex data analysis, then add scientific information about the behavior of genes or protein sequences. It is a Java-based independent platform, which allows you to perform comprehensive data analysis. The software can access online databases or libraries of information, thus being able to compare or append data.

    Moreover, it facilitates the quick annotation of a large dataset by transferring functional labels from already analysed data to similar sets. The application also offers several tools for statistical analysis or data visualization.

    The application allows you to perform blast tests, InterPro scans or data mapping, before adding a large series of annotations and generating statistical charts. The informational panels at the bottom of the window indicate the progress of several processes running in parallel, as well as the analysis result.

    Blast2GO allows you to load entire projects, sequences, analysis results, gene symbols list or annotations, as well as easily export datasets. The analysis implies the comparison with online services. For example the protein blast can be performed via CloudBlast, NCBI, AWS or Local blast. You may also run an InterProScan, using one of the available applications or mapping of the blast hits, for each sequence.

    The annotation process implies that you set several parameters, such as e-Value hit filter, HSP-hit coverage or computational analysis evidence codes. The results of annotating the sequences are displayed in the main interface, under the Length, number of Hits, e-Value, sim mean, GO hits, GO list, enzyme list and InterPro scan.

    Blast2GO can display a series of charts, in tabbed view, in the area below the main table. Distribution charts can be generated for e-Values, sequence similarity, species and many more. Additionally, each sequence entry is automatically colorized pending a test, in order to indicate the data source. The software is a suitable tool for bio-engineers who study the behavior of genes and proteins, by experimenting.